Параллельный метод объединения результатов работы программ по сборке генома

Аннотация

В данной работе проводится исследование в области применения многопроцессорных систем для задачи коррекции сборки генома. Существует большое количество алгоритмических подходов к проблеме сборки генома из набора коротких фрагментов, при этом результаты их работы на одних и тех же экспериментальных данных зачастую существенно разнятся. Вследствие большого объема данных необходима организация вычислений в модели распре деленной памяти на вычислительном кластере. Предлагаемый подход использует комбинацию выводов программ сборки гeномов, что позволяет сделать результат более корректным в биологическом смысле.