Классифицирующее правило для прогноза механизма действия противоопухолевых средств

Авторы

  • Надежда Николаевна Палько Автор
  • Владимир Александрович Потёмкин Автор
  • Мария Александровна Гришина Автор

Аннотация

Проведена классификация по механизму действия противоопухолевых соединений с использованием количественных дескрипторов. Рассмотрено 115 соединений с известной активностью и механизмом действия: 30 структур алкилирующего действия, 23 соединения – ингибиторы топоизомеразы I, 16 структур – ингибиторы топоизомеразы II, 17 соединений – антиметаболиты ДНК/РНК (ингибиторы дигидрофолатредуктазы), 16 молекул – антиметаболиты ДНК, 13 соединений – антимитотики. Структуры были взяты из базы данных Национального Института Рака (США). С использованием дескрипторов, рассчитанных в рамках модели MERA, построено классифицирующее правило для прогноза механизма действия противоопухолевых лекарственных средств. Определены важные квантово-химические дескрипторы для структур алкилирующего действия, антиметаболитов ДНК/РНК и антиметаболитов ДНК. Установлены квантово-химические и геометрические дескрипторы для ингибиторов топоизомеразы II и геометрические дескрипторы для ингибиторов топоизомеразы I. Определен важный энергетический дескриптор для антимитотиков. Установлены значения дескрипторов для активных и неактивных структур каждого механизма действия. Определено качество распознавания классифицирующего правила для всех рассматриваемых механизмов действия лекарственных средств. Максимальное значение качества распознавания активных и неактивных соединений наблюдаются у ингибиторов топоизомеразы II. Минимальное значение качества распознавания активных и неактивных соединений наблюдаются у антиметаболитов ДНК/РНК. Предлагаемые классифицирующие правила могут использоваться для определения механизма действия противоопухолевых соединений.

Биографии авторов

  • Надежда Николаевна Палько
    младший научный сотрудник Научно-исследовательской лаборатории компьютерного моделирования лекарственных средств Высшей медико-биологической школы
  • Владимир Александрович Потёмкин
    кандидат химических наук, начальник Научно-исследовательской лаборатории компьютерного моделирования лекарственных средств Высшей медико-биологической школы
  • Мария Александровна Гришина
    доктор химических наук, главный научный сотрудник Научно-исследовательской лаборатории компьютерного моделирования лекарственных средств Высшей медико-биологической школы

Опубликован

2019-03-28

Выпуск

Раздел

Физическая химия