Уточнение структуры винпоцетина методом РСА

Авторы

  • Наталья Валерьевна Словеснова Автор
  • Павел Александрович Слепухин Автор
  • Анастасия Владимировна Рыбакова Автор
  • Игорь Сергеевич Ковалев Автор
  • Александр Юрьевич Петров Автор
  • Юлия Мударисовна Сайфутдинова Автор
  • Екатерина Алексеевна Кудряшова Автор
  • Татьяна Александровна Поспелова Автор
  • Дмитрий Сергеевич Копчук Автор
  • Григорий Васильевич Зырянов Автор

Аннотация

В рамках работы выполнено уточнение структуры полусинтетического алкалоида винпоцетина методом РСА с более низким значением фактора расходимости (R-фактора) по сравнению с ранее описанным в литературе. При этом кристалл винпоцетина был получен путем медленного упаривания его раствора в метаноле. По данным РСА фрагмент линеарной системы тетрагидрокарболина молекулы винпоцетина характеризуется выходом атома азота N(2) гидри-рованного пиридинового цикла из общей плоскости остальных атомов на 0,653 Å. В свою очередь ангулярная тетрагидропиридо[1,2-a]индольная система отличается выходом из её плоскости атомов углерода С(13) и С(14) на 0,806 и 0,327 Å соответственно. Ещё один шестичленный цикл расположен относительно тетрациклической системы индоло[3,2,1-de][1,5]нафтиридина под углом 83,9° и имеет конформацию кресла. В настоящей работе уточнены торсионный угол связей С(12)-С(13)-С(14)-С(15) (–85,5°) и ориентация этильного заместителя, характеризующаяся соответствующим торсионным углом С(14)-С(13)-С(18)-С(19) (67,65°). Основным структурным мотивом организации молекул в кристалле является формирование двойных лент вдоль оси b посредством слабых водородных связей типа С-Н…О (расстояние D-H…A 2,66 Å, DHA 121°, расстояние D…A 2,27 Å).

Биографии авторов

  • Наталья Валерьевна Словеснова
    ассистент кафедры фармации; младший научный сотрудник кафедры органической и биомолекулярной химии
  • Павел Александрович Слепухин
    кандидат химических наук, руководитель группы РСА; младший научный сотрудник
  • Анастасия Владимировна Рыбакова
    кандидат химических наук, доцент, доцент кафедры теоретической и прикладной химии
  • Игорь Сергеевич Ковалев
    кандидат химических наук, ведущий научный сотрудник Лаборатории перспективных материалов
  • Александр Юрьевич Петров
    доктор фармацевтических наук, профессор кафедры фармации; химик-аналитик Циклотронного центра ядерной медицины ФТИ
  • Юлия Мударисовна Сайфутдинова
    инженер-исследователь кафедры органической и биомолекулярной химии ХТИ
  • Екатерина Алексеевна Кудряшова
    инженер-исследователь Лаборатории органического синтеза НОиИЦ ХФТ ХТИ, Уральский федеральный университет
  • Татьяна Александровна Поспелова
    кандидат химических наук, ведущий специалист кафедры технологии органического синтеза ХТИ
  • Дмитрий Сергеевич Копчук
    кандидат химических наук, ведущий специалист кафедры технологии органического синтеза ХТИ 
  • Григорий Васильевич Зырянов

    доктор химических наук, профессор РАН, ведущий научный сотрудник Лаборатории координационных соединений; профессор кафедры органической и биомолекулярной химии ХТИ


Опубликован

2025-06-29